NGS
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Objetivo:
Vetor AAV que expressa CaMPARI2 (Kd = 200nM), um integrador de cálcio baseado em proteína fluorescente fotoconversível, em neurônios.
Laboratório de Apoio: Eric Schreiter
Publicação:
Moeyaert et al Nat Commun. 2018 Oct 25;9(1):4440. doi: 10.1038/s41467-018-06935-2. ( How to cite )
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Objetivo:
Plasmídeo de empacotamento de AAV que expressa genes Rep/Cap para a produção do sorotipo 2.
Laboratório de Apoio: Melina Fan
Publicação:
AAV Packaging (unpublished) ( How to cite )
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Objetivo:
Expressa ABE7.10 em células de mamíferos.
Laboratório de Apoio: David Liu
Publicação:
Gaudelli et al Nature. 2017 Nov 23;551(7681):464-471. doi: 10.1038/nature24644. Epub 2017 Oct 25. ( How to cite )
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Objetivo:
Expressar ABE7.9 em células de mamíferos.
Laboratório de Apoio: David Liu
Publicação:
Gaudelli et al Nature. 2017 Nov 23;551(7681):464-471. doi: 10.1038/nature24644. Epub 2017 Oct 25. (How to cite )Informações sobre a sequência:
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Objetivo:
Expressão de cDNA dox-repressível de MAT2A (vetor multifuncional dox-off/ tet-off).
Laboratório de Apoio: David Sabatini
Publicação:
Gu et al Science Vol. 358, Issue 6364, pp. 813-818, 10 Nov 2017 ( How to cite )
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Objetivo:
Expressar uma marcação lisossômica.
Laboratório de Apoio: David Sabatini.
Publicação:
Abu-Remaileh et al Science. 2017 Nov 10;358(6364):807-813. doi: 10.1126/science.aan6298. Epub 2017 Oct 26. ( How to cite )
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Objetivo:
Expressar uma marcação lisossômica.
Laboratório de Apoio: David Sabatini.
Publicação:
Abu-Remaileh et al Science. 2017 Nov 10;358(6364):807-813. doi: 10.1126/science.aan6298. Epub 2017 Oct 26. ( How to cite )
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Objetivo:
Plasmídeo AAV2 rep-AAV-PHP.eB cap não padrão com expressão de AAV cap controlada por um sistema de amplificação tTA-TRE.
Laboratório de Apoio: Viviana Gradinaru.
Publicação:
Chan et al Nat Neurosci. 2017 Aug;20(8):1172-1179. doi: 10.1038/nn.4593. Epub 2017 Jun 26. ( How to cite )
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Objetivo:
Plasmídeo AAV2 rep-AAV-PHP.S cap não padrão com expressão de AAV cap controlada por um sistema de amplificação tTA-TRE.
Laboratório de Apoio: Viviana Gradinaru.
Publicação:
Chan et al Nat Neurosci. 2017 Aug;20(8):1172-1179. doi: 10.1038/nn.4593. Epub 2017 Jun 26. ( How to cite )
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A análise molecular de cânceres mieloides, como leucemia mieloide aguda (LMA) e leucemia mieloide crônica (LMC), está mudando rapidamente de métodos de local único, como FISH e qPCR, para ensaios de sequenciamento de próxima geração (NGS) altamente multiplexados. Portanto, há uma demanda crescente por materiais de referência NGS altamente multiplexados e semelhantes aos do paciente, cobrindo uma ampla gama de variantes clinicamente relevantes, a fim de garantir que os ensaios mieloides novos e existentes sejam robustos, precisos e consistentes. A SeraCare desenvolveu o primeiro conjunto abrangente de materiais de referência para câncer mieloide do setor em resposta a essa necessidade crítica do mercado.
- Amostra única com 23 mutações de DNA clinicamente relevantes em 16 genes (economize US $ 1000 em custos operacionais)
- Projetado por especialistas para garantir a cobertura em variantes importantes (mistura de SNVs, indels e ITD) em frequências alélicas relevantes
- Construído com tecnologia inovadora para produzir características de amostra semelhantes às do paciente e desempenho de ensaio NGS
- Alvos de mutação quantificados com precisão com PCR digital
- Única linha celular GM24385 bem caracterizada como material de fundo do tipo selvagem
- Fabricado em instalações em conformidade com GMP e com certificação ISO 13485
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Amplificações e deleções de genes, coletivamente chamadas de variações do número de cópias (CNVs), são comuns em células cancerígenas e contribuem para o crescimento celular descontrolado, sensibilidade e resistência a medicamentos. Para apoiar os laboratórios clínicos que realizam perfis tumorais baseados em NGS de amostras de pacientes com câncer e ajudar os desenvolvedores de ensaios a desenvolver e caracterizar o desempenho de seus ensaios, a LGCSeraCare desenvolveu um material de referência abrangente de CNV de tumor sólido em formato de mistura de mutação.
CARACTERÍSTICAS E BENEFÍCIOS
- 12 CNVs clinicamente relevantes associadas a tumores sólidos
- Um único material de referência que transporta amplificações genéticas em vários níveis
- Números de cópias quantificados usando ensaios de dPCR sensíveis e combinados com o fundo genômico GM24385 bem caracterizado
- Validado por um painel NGS direcionado
- Fabricado em instalações em conformidade com GMP e com certificação ISO 13485
- Este mix CNV específico inclui +12 cópias
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Amplificações e deleções de genes, coletivamente chamadas de variações do número de cópias (CNVs), são comuns em células cancerígenas e contribuem para o crescimento celular descontrolado, sensibilidade e resistência a medicamentos. Para apoiar os laboratórios clínicos que realizam perfis tumorais baseados em NGS de amostras de pacientes com câncer e ajudar os desenvolvedores de ensaios a desenvolver e caracterizar o desempenho de seus ensaios, a LGCSeraCare desenvolveu um material de referência abrangente de CNV de tumor sólido em formato de mistura de mutação.
CARACTERÍSTICAS E BENEFÍCIOS
- 12 CNVs clinicamente relevantes associadas a tumores sólidos
- Um único material de referência que transporta amplificações genéticas em vários níveis
- Números de cópias quantificados usando ensaios de dPCR sensíveis e combinados com o fundo genômico GM24385 bem caracterizado
- Validado por um painel NGS direcionado
- Fabricado em instalações em conformidade com GMP e com certificação ISO 13485
- Este mix CNV específico inclui +3 cópias
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Amplificações e deleções de genes, coletivamente chamadas de variações do número de cópias (CNVs), são comuns em células cancerígenas e contribuem para o crescimento celular descontrolado, sensibilidade e resistência a medicamentos. Para apoiar os laboratórios clínicos que realizam perfis tumorais baseados em NGS de amostras de pacientes com câncer e ajudar os desenvolvedores de ensaios a desenvolver e caracterizar o desempenho de seus ensaios, a LGCSeraCare desenvolveu um material de referência abrangente de CNV de tumor sólido em formato de mistura de mutação.
CARACTERÍSTICAS E BENEFÍCIOS
- 12 CNVs clinicamente relevantes associadas a tumores sólidos
- Um único material de referência que transporta amplificações genéticas em vários níveis
- Números de cópias quantificados usando ensaios de dPCR sensíveis e combinados com o fundo genômico GM24385 bem caracterizado
- Validado por um painel NGS direcionado
- Fabricado em instalações em conformidade com GMP e com certificação ISO 13485
- Este mix CNV específico inclui +6 cópias
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A SeraCare continua a liderar no fornecimento de padrões de referência inovadores e adequados à finalidade para atender às crescentes necessidades dos ensaios NGS. O material de referência Seraseq® Tumor Mutation Mix DNA v3 AF7% representa um dos nossos produtos mais complexos até hoje, contendo o maior número de variantes biossintéticas em uma única mistura. Ele é projetado especificamente para suportar o desenvolvimento de ensaios NGS, validação e monitoramento de CQ de rotina
Seraseq® Tumor Mutation Mix DNA v3 AF7% contém 112 variantes em 92 genes, incluindo supressores tumorais chave, oncogenes, reparo de DNA e reguladores do ciclo celular. Essas variantes biossintéticas são misturadas em um fundo GM24385 bem caracterizado. Este material pronto para uso é otimizado para uso em fluxos de trabalho NGS após a extração de DNA até a análise posterior. Fabricado sob instalações com certificação ISO 13485 em conformidade com cGMP, este material de referência garante consistência e precisão lote a lote, apoiando resultados de testes genômicos de alta qualidade.
CARACTERÍSTICAS e BENEFÍCIOS
- 112 variantes exclusivas de DNA biossintético multiplexado em 92 genes em um único material de referência
- 51 SNVs
- 39 Indels
- 10 Translocações
- 12 CNVs
- 94 variantes reconhecidas como alvos de medicamentos da FDA apoiam a detecção abrangente de mutações clinicamente acionáveis
- Todas as variantes são direcionadas a um VAF de 7% e CNVs a +6 cópias
- Alvos de mutação quantificados por PCR digital altamente sensível e validados ortogonalmente por NGS
- Misturado com DNA genômico humano GM24385 bem caracterizado como material de tipo selvagem de fundo
- Apoiar estudos de validação de ensaio, incluindo determinação da sensibilidade do ensaio, especificidade e limite de detecção (LoD)
- Fabricado sob conformidade com cGMP e instalações certificadas pela ISO 13485
- 112 variantes exclusivas de DNA biossintético multiplexado em 92 genes em um único material de referência
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a SeraCare desenvolveu os primeiros materiais de referência de CNV específicos da doença para dar suporte a laboratórios clínicos que realizam o perfil de tumor baseado em NGS de amostras de pacientes com câncer de mama.
- Amostra única com três CNVs clinicamente relevantes (economize custos de aquisição e sequenciamento)
- Desenvolva, otimize e valide a capacidade do seu ensaio de detectar uma variedade de números de cópias (amplificações)
- Alvos de CNV quantificados com precisão com PCR digital
- DNA genômico humano GM24385 bem caracterizado como material de fundo do tipo selvagem
- Fabricado em instalações com certificação ISO 13485 e em conformidade com as GMP
Este CNV Mix específico para câncer de mama inclui 12 cópias.
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a SeraCare desenvolveu os primeiros materiais de referência de CNV específicos da doença para dar suporte a laboratórios clínicos que realizam o perfil de tumor baseado em NGS de amostras de pacientes com câncer de mama.
- Amostra única com três CNVs clinicamente relevantes (economize custos de aquisição e sequenciamento)
- Desenvolva, otimize e valide a capacidade do seu ensaio de detectar uma variedade de números de cópias (amplificações)
- Alvos de CNV quantificados com precisão com PCR digital
- DNA genômico humano GM24385 bem caracterizado como material de fundo do tipo selvagem
- Fabricado em instalações com certificação ISO 13485 e em conformidade com as GMP
Este CNV Mix específico para câncer de mama inclui 3 cópias.
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a SeraCare desenvolveu os primeiros materiais de referência de CNV específicos da doença para dar suporte a laboratórios clínicos que realizam o perfil de tumor baseado em NGS de amostras de pacientes com câncer de mama.
- Amostra única com três CNVs clinicamente relevantes (economize custos de aquisição e sequenciamento)
- Desenvolva, otimize e valide a capacidade do seu ensaio de detectar uma variedade de números de cópias (amplificações)
- Alvos de CNV quantificados com precisão com PCR digital
- DNA genômico humano GM24385 bem caracterizado como material de fundo do tipo selvagem
- Fabricado em instalações com certificação ISO 13485 e em conformidade com as GMP
Este CNV Mix específico para câncer de mama inclui 6 cópias.
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SMART-Seq Total RNA Pico Input com UMIs (ZapR Mammalian) gera bibliotecas de RNA-seq específicas de fita para sequenciamento Illumina a partir de entradas de 250 pg–10 ng de RNA total purificado ou de 10–1.000 células intactas. O design da biblioteca apresentado neste kit adiciona um identificador molecular exclusivo (UMI) de 8 nucleotídeos (nt) por meio da etapa de transcrição reversa para mitigar o potencial viés de PCR, bem como fornecer informações adicionais para quantificação de transcrição. Material suficiente é fornecido com este kit para realizar até 24 reações.
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O Kit de Preparação de Bibliotecas de DNA TransNGS® para Illumina® foi desenvolvido para a plataforma de sequenciamento de alto rendimento Illumina, projetado para construir bibliotecas de sequenciamento de forma rápida e eficiente, de 1 ng a 1 μg de dsDNA fragmentado. Este kit de reagentes é adequado para diversos tipos de amostras, incluindo DNA genômico fragmentado por sonicação, digestões enzimáticas, produtos de amplificação de ácidos nucleicos, DNA de imunoprecipitação de cromatina (DNA ChIP) e DNA de cortes de tecido incluídos em parafina (DNA FFPE), entre outros. Pode ser usado em conjunto com reagentes de captura de éxons ou outros reagentes de captura de alvos (incluindo as séries Agilent SureSelect® e Roche NimbleGen SeqCap® EZ) para sequenciamento de éxons ou sequenciamento direcionado.
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O kit foi projetado para preparar de forma rápida e eficiente uma biblioteca de DNA de 1 ng a 1 μg de DNA dupla fita fragmentado para a plataforma de sequenciamento de alto rendimento MGI. As amostras podem ser dsDNA fragmentado, como DNA genômico fragmentado por ultrassom, produtos de digestão enzimática, produtos de amplificação de ácidos nucleicos, DNA de imunoprecipitação de cromatina (DNA ChIP), DNA fixado em formalina e embebido em parafina (DNA FFPE), e podem ser combinadas com éxons ou outros reagentes de captura de alvos para sequenciamento de éxons ou sequenciamento de captura de alvos.