O fragmento C5a do complemento é um glicopolipeptídeo de 74 resíduos gerado pela clivagem proteolítica do fator C5 do complemento durante a ativação do complemento. O C5a é um potente quimiotático e anafilatoxina que atua em todas as classes de leucócitos e em muitos outros tipos celulares, incluindo células endoteliais, musculares lisas, renais, hepáticas e neurais. Além de seus efeitos pró-inflamatórios, o C5a demonstrou proteger as células contra insultos tóxicos e estimular a proliferação em neurônios e hepatócitos, sugerindo um papel mais amplo do C5a na homeostase. O C5a é rapidamente desarginado pela carboxipeptidase N sérica no derivado menos potente, C5a desArg, o primeiro estágio na desativação da atividade da anafilatoxina. A forma desArg do C5a possui um espectro de bioatividade diferente do C5a intacto.
O C5a recombinante de camundongo é marcado com His e possui a seguinte sequência de aminoácidos:
MRGSHHHHHHGSDYDIPTTENLYFQGGSNLHLLRQKIEEQAAKYKHSVPKKCCYDGARVNFYETCEERVARVTIGPLCIAFNECCTIANKIRKESPHKPVQLGR.
O peso molecular da proteína é de 12 kg/mol.