Sequênciamento de RNA
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O Shasta Total RNA-Seq Kit – 2 Chip permite o perfil abrangente dos transcriptomas de comprimento total de até 100.000 células únicas por execução no ICELL8 cx Single-Cell System. Os reagentes, conjuntos de primers e consumíveis incluídos no produto são suficientes para duas execuções do protocolo, uma por chip.
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O kit SMARTer Stranded Total RNA-Seq v3 – Pico Input Mammalian é usado para gerar bibliotecas de RNA-seq específicas de fita para sequenciamento Illumina a partir de entradas de 250 pg–10 ng de RNA total purificado ou de 10–1.000 células intactas. Este kit incorpora a tecnologia proprietária SMART (Switching Mechanism at the 5’ end of RNA Template) da Takara Bio e inclui refinamentos no método SMARTer para RNA-seq de fita que simplificam o fluxo de trabalho de preparação da biblioteca e melhoram o desempenho do sequenciamento. Este método foi desenvolvido para trabalhar com RNA total de alta ou baixa qualidade, não requer métodos ou kits adicionais de remoção de rRNA e produz bibliotecas de sequenciamento que retêm informações da fita de origem. A remoção integrada de cDNAs derivados de rRNA — normalmente presentes em alta abundância após a síntese de cDNA a partir de entradas de RNA total — torna o fluxo de trabalho extremamente sensível, produzindo dados altamente reprodutíveis com baixo mapeamento para rRNA. O novo design de biblioteca apresentado neste kit atualizado adiciona um identificador molecular exclusivo (UMI) de 8 nucleotídeos (nt) por meio da etapa de transcrição reversa para mitigar o potencial viés de PCR, bem como fornecer aos clientes informações adicionais para quantificação de transcrição, especificamente para variantes verdadeiras e mutações raras. Este kit inclui o SMARTer RNA Unique Dual Index Kit – 24U (Takara Bio, Cat. No. 634451). O SMARTer RNA Unique Dual Index Kit – 96U Set A e B (Cat. #s 634452 e 634457) estão disponíveis para compra. Juntos, eles oferecem até 192 índices duais exclusivos para multiplexação.