Carboxipeptidase B Cromatograficamente purificada. Uma solução em cloreto de sódio 100mM. Quimotripsina e tripsina 0,02%. Armazenar a -20°C. REQUER ENVIO ESPECIAL: ICE PACK |
≥170 unidades por mg de proteína |
Carboxypeptidase B, 50 mg
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O CPDB é ativado pela tripsina. O CPDB é altamente específico para lisina e arginina, mas mostra preferência pela arginina (Tan e Eaton 1995). Também pode atuar (em uma taxa mais lenta) sobre valina, leucina, isoleucina, asparagina, glicina e glutamina (Villegas et al. 1995, Nishihira et al. 1995). As diferenças nas especificidades entre carboxipeptidase A (CPDA) e CPDB podem ser atribuídas aos resíduos Ser205, Gly241 e Asp253 em CPDB em comparação com Gly207, Ile243 e Ile255 em CPDA (Coll et al. 1991).
Características moleculares:
Clauser et ai. estudaram o gene da preprocarboxipeptidase B de rato e descobriram que ele é organizado de maneira muito semelhante ao gene CPB1 bovino (Clauser et al. 1988). O gene CPB1 é conservado em muitos eucariotos e foi estudado em humanos, chimpanzés, cães, camundongos, ratos, galinhas, peixes-zebra e moscas da fruta (Avilés e Vendrell 2004). A forma madura de CPDB de rato é homóloga à CPDB bovina (77% idêntica), e os aminoácidos envolvidos na catálise ou na ligação do ligante não apresentam variação. A região de codificação da pré-procarboxipeptidase B consiste em 11 exons (Clauser et al. 1988). Comparações de CPDB de rato, CPDA de rato e CPDA2 de rato genes mostraram que o número, posição e composição da sequência dos exons são conservados, apesar das grandes diferenças nas sequências intervenientes (Gardell et al. 1988, e Clauser et al. 1988). Através do sequenciamento de cDNA e mRNA, o mRNA de CPDB foi determinado como sendo 1385 nucleotídeos, excluindo a cauda poli(A). O mRNA de CPDB de rato é 100 nucleotídeos mais longo que o mRNA de CPDA. Esta diferença é principalmente devido a uma região 3′ não traduzida (UTR) maior no mRNA de CPDB (Han et al. 1986).
Composição:
A principal forma de CPDB é encontrada no estado monomérico. CPDB contém 1 átomo de zinco por mol de proteína. Os resíduos que coordenam o resíduo de zinco são conservados e incluem duas histidinas, um ácido glutâmico e uma água (Avilés e Vendrell 2004).
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As colagenases AFA, AFB e AFC são derivadas de culturas cultivadas em meio completamente desprovido de componentes de origem animal e projetadas para aplicações de bioprocessamento onde a introdução de potenciais patógenos derivados de animais deve ser evitada. Os níveis de proteases secundárias são semelhantes aos tipos 1 e 2 de colagenase.
• CLSAFA é o grau AFA original projetado para ter colagenase e proteases secundárias semelhantes às colagenases dos Tipos 1 e 2.
• CLSAFB contém maiores atividades de colagenase e caseinase do que CLSAFA.
• CLSAFC tem atividade tríptica especialmente baixa semelhante à colagenase tipo 4.A Worthington também oferece preparações filtradas de 0,22 mícron de cada tipo em forma pré-embalada de 50 mg/frasco para reconstituição direta e uso em todos os procedimentos de isolamento.
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A lisozima hidrolisa preferencialmente as ligações β-1,4 glicosídicas entre o ácido N-acetilmurâmico e a N-acetilglucosamina que ocorrem na estrutura da parede celular do mucopeptídeo de certos microrganismos, como Micrococcus lysodeikticus (Código do produto: ML). Uma atividade ligeiramente mais limitada é exibida em relação aos oligômeros de quitina. Tem um peso molecular de 14.388 daltons. O pH ótimo é 9,2. A lisozima é inibida por agentes tensoativos como dodecil sulfato, álcool e ácidos graxos. Derivados de imidazol e indol formam complexos de transferência de carga inibitória.
Estabilidade/Armazenamento : Estável por 3-5 anos a 2-8°C. Soluções em pH 4-5 são estáveis por várias semanas sob refrigeração e por dias em temperatura ambiente. Armazenar a 2-8°C.
Nota técnica : Devido a diferenças de ensaio, 8.000u/mg pelo ensaio de Worthington é equivalente a 50.000u/mg reivindicado por outros fornecedores.
Definição de Unidade : Uma Unidade é igual a uma diminuição na turbidez de 0,001 por minuto a 450 nm a pH 7,0 e 25°C, usando uma suspensão de 0,3 mg/ml de células Micrococcus lysodeikticus (código de produto WBC ML) como substrato.
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A pepsina tem ampla especificidade com preferência por peptídeos contendo ligações com L-aminoácidos aromáticos ou carboxílicos. Ele cliva preferencialmente C-terminal para Phe e Leu e, em menor grau, ligações Glu. A enzima não cliva em Val, Ala ou Gly.
Características moleculares:
A sequência de aminoácidos da pepsina suína foi determinada por Tang et al. (1973) e Moravek e Kostka (1974), e posteriormente confirmado por análise de cDNA por Tsukagoshi et al. (1988) e Lin et al. (1989).
O gene do pepsinogênio A ( PGA ) é dividido entre nove éxons que abrangem aproximadamente 9,4 kb de DNA genômico (Sogawa 1983).
Existem várias versões dos genes PGA encontrados em populações humanas e de chimpanzés, mas as atividades desses vários produtos gênicos são indistinguíveis (Taggart 1985 e Zelle 1988). Em contraste, análises de Southern blot de uma amostragem de porcos sugerem que há apenas um único gene PGA encontrado em todos os porcos (Evers 1988).
A produção de PGA é controlada principalmente ao nível da transcrição (Sogawa et al. 1981 e Ichinose et al. 1988). Em humanos e porcos, verificou-se que o gene PGA está sob controle transcricional específico do tecido, com mRNA detectado apenas na mucosa fúndica gástrica (Ichinose 1991 e Meijerink et al. 1993). A transcrição do gene PGA é regulada por proteínas ativadoras da transcrição que atuam em 3 regiões principais nas regiões promotoras e de iniciação do gene PGA (Meijerink et al. 1993).
Existem quatro proteínas pepsinas relatadas: pepsina A, pepsina B (parapepsina I), pepsina C (gastricsina) e pepsina D (uma versão não fosforilada da pepsina A) (Lee e Ryle 1967). A pepsina A é a protease gástrica predominante; pequenas quantidades das outras pepsinas foram detectadas. As pepsinas B e C compartilham um maior grau de homologia entre si. No cão, B e C compartilham 89% de identidade, A e B compartilham 44% de identidade e A e C compartilham 45% de identidade (calculado com base em Thompson et al. 1994).
Composição:
A pepsina é uma proteína monomérica, de dois domínios, principalmente beta, com alta porcentagem de resíduos ácidos. A pepsina suína tem 4 resíduos básicos e 42 resíduos ácidos e é O -fosforilada em S68 (Tang et al. 1973). Para que a proteína seja ativa, um dos dois resíduos de aspartato no sítio catalítico deve ser protonado e o outro desprotonado. Isso ocorre entre pH 1 e 5, e acima de pH 7 a pepsina é irreversivelmente desnaturada.
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A tripsina é uma serina protease pancreática com especificidade de substrato baseada em cadeias laterais de lisina e arginina carregadas positivamente. É derivado de um zimogênio precursor inativo de 34 kDa, tripsinogênio, após remoção enzimática de uma sequência líder de 6 aminoácidos N-terminal resultando na molécula de tripsina de 23,8 kDa. O pH ótimo é 8,0. A tripsina é inibida por compostos organofosforados, como diisopropilfluorofosfato e inibidores naturais do pâncreas. Soja, feijão de lima e clara de ovo também são fontes de inibidores naturais. A tripsina cliva as ligações amida e éster de Arg e Lys. A Tripsina de Grau de Sequenciamento de Worthington foi ainda purificada para remover vestígios de proteases contaminantes e produtos de autólise que poderiam interferir em experimentos de digestão de tripsina e exibe uma única banda no PAGE.